Dify 框架连接 PGSQL 数据库与 Sandbox 环境下的 Linux 系统调用权限问题
Dify 框架连接 PGSQL 数据库与 Sandbox 环境下的 Linux 系统调用权限问题
背景
在使用 Dify 框架进行开发时，遇到了两个主要的技术挑战：
- 代码节点连接到 PGSQL（PostgreSQL）数据库。
- 解决沙盒环境中由于系统调用限制导致的“operation not permitted”错误。
本文档将详细描述如何解决这两个问题，并介绍 psycopg2-binary Python 依赖的作用及其配置方法。同时，我们将强调配置文件修改后正确重启服务的重要性。
技术解决方案
PGSQL 数据库连接
为了使基于 Python 的 Dify 应用能够与 PostgreSQL 数据库通信，我们在 volumessandboxdependenciespython-requirements.txt 文件中添加了 psycopg2-binary==2.9.10 依赖。该库提供了一个 PostgreSQL 数据库适配器，它包含了预编译的二进制文件，简化了安装过程，避免了需要单独编译 C 扩展的问题。
# volumes/sandbox/dependencies/python-requirements.txt
psycopg2-binary==2.9.10当 Docker Compose 构建服务时，它会读取此文件并安装列出的所有 Python 包，包括 psycopg2-binary，从而为应用程序提供与 PGSQL 数据库交互的能力。安装完成后，通过代码节点配置应用中的数据库连接参数（如主机、端口、用户名、密码等），实现了代码节点与 PGSQL 数据库的成功连接。
Sandbox 中的 Linux 系统调用权限问题
在尝试运行代码节点时，遇到了如下错误信息：
error: operation not permitted此错误表明应用程序尝试执行的操作被操作系统或沙盒环境所禁止。经分析，确定这是由于沙盒环境中对特定 Linux 系统调用的访问权限不足造成的。
为了解决这个问题，采取了以下步骤：
- 调整沙盒策略：在
volumessandboxconfconfig.yaml文件中扩展了allowed_syscalls列表，以允许必要的系统调用。这确保了沙盒内的应用程序可以执行所需的底层操作系统功能，而不会遇到权限错误。
下面是一个简化的 config.yaml 配置示例，其中列出了部分关键系统调用编号，表示这些操作是被允许的：
allowed_syscalls:
# 基础文件操作
- 0 # read - 从文件描述符读取数据
- 1 # write - 向文件描述符写入数据
- 2 # open - 打开文件
- 3 # close - 关闭文件描述符
- 4 # stat - 获取文件状态
- 5 # fstat - 获取文件描述符状态
- 6 # lstat - 获取符号链接状态
- 7 # poll - 等待文件描述符上的事件
- 8 # lseek - 重新定位读/写文件偏移量
- 9 # mmap - 将文件或设备映射到内存
- 10 # mprotect - 设置内存区域的保护
- 11 # munmap - 取消内存映射
- 12 # brk - 改变数据段大小
# 系统操作
- 13 # rt_sigaction - 检查或修改信号处理
- 14 # rt_sigprocmask - 检查或修改阻塞信号
- 15 # rt_sigreturn - 从信号处理程序返回
- 16 # ioctl - 控制设备
- 17 # pread64 - 从指定偏移量读取
- 18 # pwrite64 - 向指定偏移量写入
- 19 # readv - 从文件描述符读取数据到多个缓冲区
- 20 # writev - 从多个缓冲区写入数据到文件描述符
- 21 # access - 检查文件访问权限
- 22 # pipe - 创建管道
- 23 # select - 同步 I/O 多路复用
- 24 # sched_yield - 让出处理器
- 25 # mremap - 重新映射虚拟内存地址
# 高级内存管理
- 26 # msync - 同步内存与物理存储
- 27 # mincore - 确定内存页是否驻留在内存中
- 28 # madvise - 给出内存使用建议
- 29 # shmget - 获取共享内存段
- 30 # shmat - 附加共享内存段
- 31 # shmctl - 共享内存控制
- 32 # dup - 复制文件描述符
- 33 # dup2 - 复制文件描述符到指定编号
- 34 # pause - 挂起进程直到收到信号
# 进程管理
- 35 # nanosleep - 高精度睡眠
- 36 # getitimer - 获取定时器值
- 37 # alarm - 设置定时器
- 38 # setitimer - 设置定时器
- 39 # getpid - 获取进程ID
- 40 # sendfile - 在文件描述符之间传输数据
# 网络操作
- 41 # socket - 创建套接字
- 42 # connect - 初始化套接字连接
- 43 # accept - 接受套接字连接
- 44 # sendto - 通过套接字发送消息
- 45 # recvfrom - 从套接字接收消息
- 46 # sendmsg - 通过套接字发送消息
- 47 # recvmsg - 通过套接字接收消息
- 48 # shutdown - 关闭套接字连接
- 49 # bind - 绑定套接字到地址
- 50 # listen - 监听套接字连接
# 进程间通信
- 51 # getsockname - 获取套接字本地地址
- 52 # getpeername - 获取套接字对端地址
- 53 # socketpair - 创建一对已连接的套接字
- 54 # setsockopt - 设置套接字选项
- 55 # getsockopt - 获取套接字选项
# 进程控制
- 56 # clone - 创建子进程
- 57 # fork - 创建进程
- 58 # vfork - 创建进程并阻塞父进程
- 59 # execve - 执行程序
- 60 # exit - 终止进程
- 61 # wait4 - 等待进程改变状态
- 62 # kill - 发送信号
# 信号处理
- 63 # uname - 获取系统信息
- 64 # semget - 获取信号量集
- 65 # semop - 信号量操作
- 66 # semctl - 信号量控制
- 67 # shmdt - 分离共享内存段
- 68 # msgget - 获取消息队列
- 69 # msgsnd - 发送消息到队列
- 70 # msgrcv - 从队列接收消息
- 71 # msgctl - 消息队列控制
# 文件系统操作
- 72 # fcntl - 文件描述符控制
- 73 # flock - 应用或删除文件锁
- 74 # fsync - 同步文件到存储设备
- 75 # fdatasync - 同步文件数据
- 76 # truncate - 截断文件
- 77 # ftruncate - 截断文件描述符指向的文件
- 78 # getdents - 获取目录项
- 79 # getcwd - 获取当前工作目录
- 80 # chdir - 改变当前工作目录
# 文件系统管理
- 81 # fchdir - 通过文件描述符改变当前工作目录
- 82 # rename - 重命名文件
- 83 # mkdir - 创建目录
- 84 # rmdir - 删除目录
- 85 # creat - 创建新文件
- 86 # link - 创建硬链接
- 87 # unlink - 删除文件名
- 88 # symlink - 创建符号链接
- 89 # readlink - 读取符号链接的值
- 90 # chmod - 改变文件权限
# 权限和所有权
- 91 # fchmod - 改变文件描述符的权限
- 92 # chown - 改变文件所有者和组
- 93 # fchown - 改变文件描述符指向文件的所有者和组
- 94 # lchown - 改变符号链接的所有者和组
- 95 # umask - 设置文件模式创建掩码
# 系统信息和统计
- 96 # gettimeofday - 获取时间和日期
- 97 # getrlimit - 获取资源限制
- 98 # getrusage - 获取资源使用情况
- 99 # sysinfo - 获取系统统计信息
- 100 # times - 获取进程时间
# 系统控制
- 101 # ptrace - 进程跟踪
- 102 # getuid - 获取用户ID
- 103 # syslog - 读取或清除内核消息
- 104 # getgid - 获取组ID
- 105 # setuid - 设置用户ID
- 106 # setgid - 设置组ID
# 用户和组管理
- 107 # geteuid - 获取有效用户ID
- 108 # getegid - 获取有效组ID
- 109 # setpgid - 设置进程组
- 110 # getppid - 获取父进程ID
- 111 # getpgrp - 获取进程组ID
# 会话管理
- 112 # setsid - 创建会话并设置进程组ID
- 113 # setreuid - 设置实际和有效用户ID
- 114 # setregid - 设置实际和有效组ID
- 115 # getgroups - 获取附加组ID
- 116 # setgroups - 设置附加组ID
# 系统资源管理
- 117 # setresuid - 设置实际、有效和保存的用户ID
- 118 # getresuid - 获取实际、有效和保存的用户ID
- 119 # setresgid - 设置实际、有效和保存的组ID
- 120 # getresgid - 获取实际、有效和保存的组ID
# 系统时间管理
- 121 # getpgid - 获取进程组ID
- 122 # setfsuid - 设置文件系统用户ID
- 123 # setfsgid - 设置文件系统组ID
- 124 # getsid - 获取会话ID
- 125 # capget - 获取进程权能
- 126 # capset - 设置进程权能
# 实时调度
- 127 # rt_sigpending - 检查待处理信号
- 128 # rt_sigtimedwait - 同步等待信号
- 129 # rt_sigqueueinfo - 排队一个信号和数据
- 130 # rt_sigsuspend - 等待信号
# 高级进程管理
- 131 # sigaltstack - 设置和获取信号栈上下文
- 132 # utime - 改变文件的访问和修改时间
- 133 # mknod - 创建特殊文件
- 134 # uselib - 加载共享库
- 135 # personality - 设置进程执行域
# 系统调用
- 136 # ustat - 获取文件系统统计信息
- 137 # statfs - 获取文件系统信息
- 138 # fstatfs - 获取文件系统信息
- 139 # sysfs - 获取文件系统类型信息
- 140 # getpriority - 获取程序调度优先级
# 进程优先级
- 141 # setpriority - 设置程序调度优先级
- 142 # sched_setparam - 设置调度参数
- 143 # sched_getparam - 获取调度参数
- 144 # sched_setscheduler - 设置调度策略和参数
- 145 # sched_getscheduler - 获取调度策略
# 调度策略
- 146 # sched_get_priority_max - 获取静态优先级上限
- 147 # sched_get_priority_min - 获取静态优先级下限
- 148 # sched_rr_get_interval - 获取时间片
- 149 # mlock - 锁定内存页
- 150 # munlock - 解锁内存页
# 内存锁定
- 151 # mlockall - 锁定进程的地址空间
- 152 # munlockall - 解锁进程的地址空间
- 153 # vhangup - 虚拟挂起终端
- 154 # modify_ldt - 读取或写入本地描述符表
- 155 # pivot_root - 改变根文件系统
# 系统引导
- 156 # _sysctl - 读取/写入系统参数
- 157 # prctl - 操作进程或线程
- 158 # arch_prctl - 设置架构特定的线程状态
- 159 # adjtimex - 调整系统时钟
# 文件系统控制
- 161 # chroot - 改变根目录
- 162 # sync - 同步文件系统缓冲区
- 163 # acct - 切换进程记账
- 164 # settimeofday - 设置时间和日期
- 165 # mount - 挂载文件系统
# 系统维护
- 166 # umount2 - 卸载文件系统
- 167 # swapon - 开启交换设备和文件
- 168 # swapoff - 关闭交换设备和文件
- 169 # reboot - 重新启动系统
- 170 # sethostname - 设置系统主机名
# 网络配置
- 171 # setdomainname - 设置系统域名
- 172 # iopl - 改变I/O权限级别
- 173 # ioperm - 设置端口I/O权限
- 174 # create_module - 创建可加载的模块项
- 175 # init_module - 初始化内核模块
# 内核模块
- 176 # delete_module - 删除内核模块
- 177 # get_kernel_syms - 检索导出的内核符号
- 178 # query_module - 查询内核模块信息
- 179 # quotactl - 操作文件系统配额
- 180 # nfsservctl - NFS服务器控制
# 系统信息查询
- 181 # getpmsg - 接收控制消息
- 182 # putpmsg - 发送控制消息
- 183 # afs_syscall - 未实现的系统调用
- 184 # tuxcall - 未实现的系统调用
- 185 # security - 未实现的系统调用
# 新增系统调用
- 186 # gettid - 获取线程标识符
- 187 # readahead - 预读文件到页面缓存
- 188 # setxattr - 设置扩展属性
- 189 # lsetxattr - 设置符号链接的扩展属性
- 190 # fsetxattr - 设置文件描述符的扩展属性
# 扩展属性操作
- 191 # getxattr - 获取扩展属性
- 192 # lgetxattr - 获取符号链接的扩展属性
- 193 # fgetxattr - 获取文件描述符的扩展属性
- 194 # listxattr - 列出扩展属性
- 195 # llistxattr - 列出符号链接的扩展属性
# 高级文件系统特性
- 196 # flistxattr - 列出文件描述符的扩展属性
- 197 # removexattr - 删除扩展属性
- 198 # lremovexattr - 删除符号链接的扩展属性
- 199 # fremovexattr - 删除文件描述符的扩展属性
- 200 # tkill - 发送信号到线程
# 时间管理
- 201 # time - 获取时间
- 202 # futex - 快速用户空间锁定
- 203 # sched_setaffinity - 设置进程的CPU亲和性掩码
- 204 # sched_getaffinity - 获取进程的CPU亲和性掩码
- 205 # set_thread_area - 设置线程本地存储
# 进程/线程控制
- 206 # io_setup - 创建异步I/O上下文
- 207 # io_destroy - 销毁异步I/O上下文
- 208 # io_getevents - 从完成队列读取异步I/O事件
- 209 # io_submit - 提交异步I/O块
- 210 # io_cancel - 取消异步I/O操作
# 异步I/O
- 211 # get_thread_area - 获取线程本地存储
- 212 # lookup_dcookie - 获取目录cookie的路径
- 213 # epoll_create - 创建epoll实例
- 214 # epoll_ctl_old - 旧的epoll控制接口
- 215 # epoll_wait_old - 旧的epoll等待接口
# 事件通知
- 216 # remap_file_pages - 创建非线性文件映射
- 217 # getdents64 - 获取目录项（64位版本）
- 218 # set_tid_address - 设置清除子线程ID的地址
- 219 # restart_syscall - 重启被中断的系统调用
- 220 # semtimedop - 带超时的信号量操作
# 定时器和时钟
- 221 # fadvise64 - 预声明访问模式
- 222 # timer_create - 创建POSIX定时器
- 223 # timer_settime - 设置定时器的时间
- 224 # timer_gettime - 获取定时器的时间
- 225 # timer_getoverrun - 获取定时器超限次数
# POSIX定时器
- 226 # timer_delete - 删除POSIX定时器
- 227 # clock_settime - 设置指定时钟的时间
- 228 # clock_gettime - 获取指定时钟的时间
- 229 # clock_getres - 获取时钟精度
- 230 # clock_nanosleep - 高精度睡眠
# 进程终止
- 231 # exit_group - 终止所有线程
- 232 # epoll_wait - 等待epoll事件
- 233 # epoll_ctl - 控制epoll实例
- 234 # tgkill - 发送信号到线程
- 235 # utimes - 更改文件访问和修改时间
# 虚拟内存操作
- 236 # vserver - Linux-VServer操作
- 237 # mbind - 设置内存策略
- 238 # set_mempolicy - 设置NUMA内存策略
- 239 # get_mempolicy - 检索NUMA内存策略
- 240 # mq_open - 打开消息队列
# POSIX消息队列
- 241 # mq_unlink - 删除消息队列
- 242 # mq_timedsend - 发送消息到队列
- 243 # mq_timedreceive - 从队列接收消息
- 244 # mq_notify - 注册消息队列通知
- 245 # mq_getsetattr - 获取/设置消息队列属性
# 密钥管理
- 246 # kexec_load - 加载新内核
- 247 # waitid - 等待进程状态改变
- 248 # add_key - 添加密钥到内核密钥管理系统
- 249 # request_key - 请求操作密钥
- 250 # keyctl - 密钥管理控制
# 输入输出多路复用
- 251 # ioprio_set - 设置I/O调度优先级
- 252 # ioprio_get - 获取I/O调度优先级
- 253 # inotify_init - 初始化inotify实例
- 254 # inotify_add_watch - 添加inotify监视
- 255 # inotify_rm_watch - 删除inotify监视
# 文件系统监控
- 256 # migrate_pages - 在NUMA系统中迁移进程页
- 257 # openat - 相对路径打开文件
- 258 # mkdirat - 相对路径创建目录
- 259 # mknodat - 相对路径创建特殊文件
- 260 # fchownat - 相对路径改变所有权
# 相对路径操作
- 261 # futimesat - 相对路径更改时间戳
- 262 # newfstatat - 相对路径获取文件状态
- 263 # unlinkat - 相对路径删除文件
- 264 # renameat - 相对路径重命名
- 265 # linkat - 相对路径创建硬链接
# 符号链接操作
- 266 # symlinkat - 相对路径创建符号链接
- 267 # readlinkat - 相对路径读取符号链接
- 268 # fchmodat - 相对路径改变权限
- 269 # faccessat - 相对路径检查访问权限
- 270 # pselect6 - 改进的select系统调用
# 高级I/O操作
- 271 # ppoll - 改进的poll系统调用
- 272 # unshare - 解除共享命名空间
- 273 # set_robust_list - 设置健壮的futex列表
- 274 # get_robust_list - 获取健壮的futex列表
- 275 # splice - 在文件描述符之间移动数据
# 零拷贝操作
- 276 # tee - 复制管道数据
- 277 # sync_file_range - 同步文件段
- 278 # vmsplice - 在进程和内核之间传输数据
- 279 # move_pages - 在NUMA系统中移动页面
- 280 # utimensat - 相对路径更改文件时间戳
# 事件通知
- 281 # epoll_pwait - 等待epoll事件，可中断
- 282 # signalfd - 创建信号接收文件描述符
- 283 # timerfd_create - 创建定时器文件描述符
- 284 # eventfd - 创建事件通知文件描述符
- 285 # fallocate - 预分配文件空间
# 定时器操作
- 286 # timerfd_settime - 设置定时器文件描述符
- 287 # timerfd_gettime - 读取定时器文件描述符
- 288 # accept4 - 接受带标志的连接
- 289 # signalfd4 - 改进的signalfd
- 290 # eventfd2 - 改进的eventfd
# 文件系统操作
- 291 # epoll_create1 - 改进的epoll_create
- 292 # dup3 - 改进的dup2
- 293 # pipe2 - 改进的pipe
- 294 # inotify_init1 - 改进的inotify_init
- 295 # preadv - 向量化的pread
# 向量I/O操作
- 296 # pwritev - 向量化的pwrite
- 297 # rt_tgsigqueueinfo - 排队实时信号到线程组
- 298 # perf_event_open - 性能监控
- 299 # recvmmsg - 接收多个消息
- 300 # fanotify_init - 初始化fanotify
# 文件系统通知
- 301 # fanotify_mark - 管理fanotify标记
- 302 # prlimit64 - 获取/设置资源限制
- 303 # name_to_handle_at - 文件句柄操作
- 304 # open_by_handle_at - 通过文件句柄打开
- 305 # clock_adjtime - 调整系统时钟
# 同步操作
- 306 # syncfs - 同步文件系统
- 307 # sendmmsg - 发送多个消息
- 308 # setns - 设置命名空间
- 309 # getcpu - 获取CPU和NUMA节点
- 310 # process_vm_readv - 进程间读取数据
# 进程间通信
- 311 # process_vm_writev - 进程间写入数据
- 312 # kcmp - 内核比较两个进程
- 313 # finit_module - 从文件描述符加载内核模块
- 314 # sched_setattr - 设置调度属性
- 315 # sched_getattr - 获取调度属性
# 安全计算
- 316 # renameat2 - 扩展的重命名操作
- 317 # seccomp - 设置安全计算模式
- 318 # getrandom - 获取随机数
- 319 # memfd_create - 创建匿名文件
- 320 # kexec_file_load - 从文件加载新内核
# 命名空间操作
- 321 # bpf - 扩展的BPF系统调用
- 322 # execveat - 相对路径执行程序
- 323 # userfaultfd - 用户页错误处理
- 324 # membarrier - 发出内存屏障
- 325 # mlock2 - 改进的内存锁定
# 套接字操作
- 326 # copy_file_range - 复制文件范围
- 327 # preadv2 - 带标志的向量化pread
- 328 # pwritev2 - 带标志的向量化pwrite
- 329 # pkey_mprotect - 设置内存保护键
- 330 # pkey_alloc - 分配内存保护键
# 内存保护
- 331 # pkey_free - 释放内存保护键
- 332 # statx - 扩展的文件状态
- 333 # io_pgetevents - 获取异步I/O事件
- 334 # rseq - 重启序列
- 335 # pidfd_send_signal - 通过文件描述符发送信号- 验证更改：在实施上述更改后，重新测试应用程序，确认错误已解决且应用程序可以正常工作，同时确保没有引入额外的安全风险。
修改 docker-compose.yaml 以挂载本地配置文件
默认情况下，Dify 可能不会自动挂载本地配置文件到容器中。为了确保我们的自定义配置文件（如 config.yaml）能够在容器内生效，我们需要修改 docker/docker-compose.yaml 文件，添加卷挂载选项，以便将本地配置目录挂载到容器内的相应位置。
在 docker/docker-compose.yaml 文件中找到 sandbox 服务的部分，并添加以下行来挂载本地配置文件：
yaml深色版本
services:
sandbox:
# 其他配置...
volumes:
- ./volumes/sandbox/conf:/conf # 添加这一行以挂载本地配置文件
- ./volumes/sandbox/dependencies:/dependencies # 如果有其他依赖项也需要挂载
# 其他配置...这样做的好处是可以直接在本地编辑配置文件，而不需要每次都进入容器内部进行修改，提高了开发和调试效率。
结果
通过上述措施，成功解决了应用程序连接 PGSQL 数据库的问题，并克服了沙盒环境下系统调用权限不足的障碍。最终，代码节点能够在保留安全性的同时正确地与外部资源交互。
注意事项
配置文件修改完成后，确保正确重启 Dify 服务以应用更改非常重要。为了保证新的配置生效，必须使用 docker compose stop 和 docker compose up -d 命令来重启 Dify。这是因为这些命令会确保 Docker Compose 重新读取并应用最新的配置文件更改。
正确的重启步骤
停止当前运行的服务：使用
docker compose stop命令来停止所有由 Docker Compose 启动的服务。这一步确保所有容器都停止运行，以便可以重新创建和启动它们。docker compose stop重新启动服务：使用
docker compose up -d命令来后台启动服务。这个命令会根据最新的docker-compose.yml文件以及其他关联的配置文件（如python-requirements.txt和config.yaml）重新创建和启动容器。docker compose up -d
不推荐的重启方法
- 通过可视化工具（如 Podman 的界面）来重启：这种方式可能不会触发 Docker Compose 重新加载配置文件，因此可能导致新配置不被应用。此外，不同工具的实现细节可能会有所不同，不能保证它们会按照预期处理配置更新。
确认配置更新
在完成上述重启步骤后，建议检查日志输出或直接测试应用程序的功能，以确认新的配置已经成功应用。可以通过以下命令查看服务的日志：
docker compose logs -f这样可以实时监控服务启动过程中的输出，并验证是否遇到任何问题。
